Gradnjo vodnjaka ureja zakon. Za njegovo izvajanje morajo biti izpolnjeni pogoji, določeni v zakonu o vodah ter rudarskem in geološkem zakonu. V skladu s čl. 36. vodne pravice ima lastnik zemljišča pravico do t.i redna raba vode, ki je njegova last, in podtalnice na svojem zemljišču, če ta služi za potrebe lastnega gospodinjstva.
Za gradnjo vodnih naprav je potrebno vodno dovoljenje. Dovoljenje za gradnjo vodnjakov do globine 30 m za »običajno rabo« ni potrebno, če zajem vode ne presega 5 m3 na dan. Če globina vodnjaka, namenjenega za navadno rabo vode, ne presega 30 m, za tak vodnjak ne velja geološko rudarska zakonodaja – sicer morajo biti izpolnjeni pogoji, določeni v predpisih, npr. razviti projekt vrtanja vodnjaka in ga odobriti vojvoda
Ne glede na navedeno je treba izvedbo gradbenih del prijaviti starosti (županu mesta). V obvestilu mora biti navedena vrsta, obseg in način izvajanja gradbenih del, datum njihovega začetka ter priložene skice ali načrti. Tehnični pogoji za gradnjo vodnjaka so opredeljeni z določbami Odloka ministra za infrastrukturo z dne 12. aprila 2002 o tehničnih pogojih, ki jih morajo izpolnjevati objekti in njihova lokacija (§ 31-33); m.v odmik vodnjakov naj bo 5 m od meje parcele, 7,5 m od osi obcestnega jarka in 15 m od zbiralnikov odpadkov
